（一）審計主體的多樣性。高校重大科研項目的資助經(jīng)費(fèi)主要來源于國家財政專項撥款，其管理和使用應(yīng)接受科技部、財政部以及項目依托單位主管部門等的檢查與監(jiān)督。就目前所開展的“ 863”、“ 973”等國家重大科研項目的審計實踐來看，主要是由國家審計機(jī)關(guān)或由科技部條件財務(wù)司委托事務(wù)所實施外部審計。“橫向”項目主要由合作單位委托社會審計進(jìn)行；另一方面，當(dāng)前我國高校普遍設(shè)立了內(nèi)部審計機(jī)構(gòu)，高校內(nèi)部審計的監(jiān)管職能不斷加強(qiáng)，對重大科研項目的審計也應(yīng)成為內(nèi)審部門的重要職能。需要注意的是，內(nèi)部審計與國家審計、社會審計均具有較強(qiáng)的監(jiān)督制衡作用，但其作用層次、領(lǐng)域和方式是有差異的。內(nèi)部審計的核心是對科研經(jīng)費(fèi)管理過程進(jìn)行有效的、全面的監(jiān)督，優(yōu)勢體現(xiàn)在過程控制、實時控制，能夠有效克服“中間過程不問責(zé)”的弊端。然而，對于虛設(shè)課題騙取資金、改頭換面多頭申報等已超出單純科研經(jīng)費(fèi)管理范疇的問題，則應(yīng)以國家審計監(jiān)督為主導(dǎo)，內(nèi)部審計主要起配合、協(xié)助的作用。
(二)審計客體的雙重性。科研項目的“項目依托單位”主要負(fù)責(zé)項目管理、經(jīng)費(fèi)財務(wù)管理和會計核算，審批大筆支出，監(jiān)督課題組在其審批權(quán)限內(nèi)的各項支出等?！罢n題組”是經(jīng)費(fèi)預(yù)算的執(zhí)行者和項目任務(wù)的完成者，“項目負(fù)責(zé)人”則是課題組的人格化表現(xiàn)，對科研經(jīng)費(fèi)支出具有“財務(wù)一支筆”的權(quán)限，并對完成項目任務(wù)承擔(dān)法律責(zé)任。因此，在“課題制”管理模式下，審計對象包括 “項目依托單位”和“項目負(fù)責(zé)人”兩個層次。
(三)審計范圍的綜合性和專項性。高校無憂論文網(wǎng)重大科研項目的內(nèi)部審計既要對科研經(jīng)費(fèi)的財務(wù)收支情況進(jìn)行監(jiān)督，又要對項目的經(jīng)濟(jì)效益和社會效益進(jìn)行評價，是一項較為復(fù)雜的綜合性審計。同時，它又是一項目標(biāo)明確的專項審計工作，核心是對科研經(jīng)費(fèi)進(jìn)行專項資金審計。大多數(shù)情況下，審計涉及的經(jīng)費(fèi)開支并不是很頻繁，因而可采用“詳細(xì)審計”的方式進(jìn)行。
(四)審計依據(jù)的契約性。高校重大科研項目的內(nèi)部審計除了要遵守 《審計法》、《財務(wù)會計準(zhǔn)則》的基本要求外，還要以國家有關(guān)部門的相關(guān)法規(guī)作為依據(jù)。另外，重大科研項目在申請立項時要編制預(yù)算，且在“立項申請書”、“任務(wù)合同書”等相關(guān)文件中對研究任務(wù)、成果形式、技術(shù)與經(jīng)濟(jì)指標(biāo)、社會與經(jīng)濟(jì)效益、完成期限、經(jīng)費(fèi)需求等都有著具體約定，可作為審計的主要依據(jù)。從這個特點(diǎn)來看，審計依據(jù)具有契約性。
(五)審計時限的多階段性。高?？蒲许椖考s定有執(zhí)行期，科研項目的內(nèi)部審計時限也以此為周期，而不一定與會計決算期一致。從內(nèi)部審計與科研項目活動的時間先后來看，審計也不應(yīng)該是一次性的，而應(yīng)該貫穿整個項目實施過程。在項目前期準(zhǔn)備階段要對經(jīng)費(fèi)預(yù)算、實施方案及合同等的制訂進(jìn)行審計，在項目實施過程中要對費(fèi)用預(yù)算執(zhí)行、費(fèi)用開支范圍等經(jīng)濟(jì)活動進(jìn)行審計，在項目完成后要對經(jīng)費(fèi)決算、合同執(zhí)行情況進(jìn)行審計。因此，高校重大科研項目審計是事前、事中、事后審計相結(jié)合的全過程控制的審計。上述特點(diǎn)決定了高校科研經(jīng)費(fèi)的內(nèi)部審計工作具有“財務(wù)收支審計”、“預(yù)決算審計”、“效益審計”、“經(jīng)濟(jì)責(zé)任審計”等綜合特征，且涉及部門眾多，是一項復(fù)雜的系統(tǒng)工程。
實踐中要注意遵循如下處理原則：
(一)與財務(wù)收支審計相結(jié)合。在開展審計工作時，財務(wù)收支審計為基礎(chǔ)?？蒲许椖拷?jīng)費(fèi)審計中仍然是采用查閱會計記錄，追蹤會計憑證、分析性復(fù)核等常用的方法，不過要注意兩點(diǎn)：一是高校一般都為申請的科研項目按負(fù)責(zé)人建立了專門的財務(wù)項目，審計查賬是以財務(wù)項目為主體的收入、支出及余額，而不是傳統(tǒng)的資產(chǎn)、負(fù)債及所有者權(quán)益科目；二是首先要理清科研經(jīng)費(fèi)資金的流向，一個項目經(jīng)常是校內(nèi)幾個教師共同申請的，而申請書上只有一個負(fù)責(zé)人，從主管單位到賬的科研經(jīng)費(fèi)分別進(jìn)入了不同教師的科研經(jīng)費(fèi)財務(wù)賬戶，僅僅檢查項目負(fù)責(zé)人的賬戶無法反映到位資金的全部情況，我們只有通過杳找銀行賬戶，從資金的源頭查到資金分配，理清資金進(jìn)入了哪些教師的財務(wù)項目，采用順查與逆查相結(jié)合的方式進(jìn)行。
(二)與預(yù)算執(zhí)行審計相結(jié)合?？蒲薪?jīng)費(fèi)管理的核心是立項階段的經(jīng)費(fèi)預(yù)算，其特點(diǎn)是，將項目實施過程中所必需的費(fèi)用都明確列入預(yù)算，這也是經(jīng)費(fèi)管理的難點(diǎn)。經(jīng)費(fèi)管理的關(guān)鍵是項目執(zhí)行階段經(jīng)費(fèi)預(yù)算的嚴(yán)格執(zhí)行，其特點(diǎn)是，被審查通過的預(yù)算成為合同執(zhí)行的根本依據(jù)?？蒲薪?jīng)費(fèi)審計中要結(jié)合預(yù)算審計方法，促使形成科學(xué)的預(yù)算方法、合理的預(yù)算體系及預(yù)算標(biāo)準(zhǔn)，使科研經(jīng)費(fèi)的審計規(guī)范化。
(三)與經(jīng)濟(jì)責(zé)任審計相結(jié)合。由于科研經(jīng)費(fèi)審計客體具有雙重性的特點(diǎn)，即審計對象包括“項目依托單位”和“項目負(fù)責(zé)人”兩個層次。要通過審計評價科研經(jīng)費(fèi)使用的真實性、合法性、效益性情況，正確反映項目依托單位和項目負(fù)責(zé)人經(jīng)費(fèi)管理職能的履行情況。因此，科研經(jīng)費(fèi)審計具有經(jīng)濟(jì)責(zé)任審計的特點(diǎn)，要與經(jīng)濟(jì)責(zé)任審計方法相結(jié)合。
(四)與效益審計相結(jié)合?？蒲薪?jīng)費(fèi)的使用效益是經(jīng)費(fèi)提供者最為關(guān)注的問題，也是衡量科研工作成效的重要標(biāo)志。針對科研效益進(jìn)行審計，必須建立相應(yīng)的經(jīng)費(fèi)使用效益評價標(biāo)準(zhǔn)。效益性評價包括技術(shù)、經(jīng)濟(jì)指標(biāo)和社會效益等方面。技術(shù)指標(biāo)的評價往往超出審計人員的專業(yè)范疇，而社會效益指標(biāo)又往往定性描述居多，也不便于操作。所以對科研項目的效益審計難以建立有效的評價標(biāo)準(zhǔn)、程序，給開展這項工作帶來很大的難度。實踐中要利用當(dāng)前效益審計研究的成果，在借鑒國內(nèi)外先進(jìn)的科研效益評價制度的基礎(chǔ)上，探索一條適合我國國情的科研經(jīng)費(fèi)效益評價體系。為使上述的處理原則成為實踐中可操作的具體辦法，必須形成系統(tǒng)、完善的內(nèi)部審計程序。與一般情況類似，科研項目的內(nèi)部審計程序也覆蓋審計準(zhǔn)備、實施、報告編制三個階段，以下分別予以闡述。
（一）審計準(zhǔn)備階段審計準(zhǔn)備階段的主要工作是明確審計任務(wù)、確定審計項目、組織安排審計人員、編制審計方案。
1.合理確定審計項目。目前各高校科研項目呈現(xiàn)逐年上升的趨勢，很多的高校現(xiàn)階段只是開展了科研課題經(jīng)費(fèi)結(jié)題的審簽工作，可將科研項目審計安排為內(nèi)部審計部門一項常規(guī)性的審計工作，依據(jù)內(nèi)部審計力量，納入年度審計計劃中。目前高?？蒲许椖繉徲嬌刑幱谄鸩诫A段，不能對所有項目進(jìn)行審計，在選擇項目時要有重點(diǎn)地對重大的研究項目開展這一工作，如：國家大型的“ 863”、“ 973”等項目。對橫向項目只是考慮在合作單位有要求的情況下，依據(jù)其委托安排審計。
2. 組成審計組。根據(jù)科研項目的特點(diǎn)，安排審計人員組成審計組，由于科研項目審計涉及到一些專業(yè)性很強(qiáng)的工程技術(shù)領(lǐng)域，在必要時可以聘請相關(guān)領(lǐng)域的專家加入審計組。
3.收集背景資料，初步了解被審計科研項目及項目負(fù)責(zé)人基本情況。一是了解項目基本情況，獲取項目立項書、審批文件、經(jīng)費(fèi)預(yù)算書、合同文書、階段性考核及驗收材料等資料，重點(diǎn)了解項目性質(zhì)、內(nèi)容、合作單位、項目周期、合同簽訂情況、經(jīng)費(fèi)預(yù)算及來源、項目的推進(jìn)計劃、完成情況及預(yù)期成果等；二是了解項目管理流程，及項目經(jīng)費(fèi)的劃撥及管理情況，向科研項目歸口管理部門詢問，獲取項目管理辦法，項目經(jīng)費(fèi)財務(wù)收支的會計資料及內(nèi)部控制制度等資料：三是了解項目負(fù)責(zé)人基本情況，聽取項目負(fù)責(zé)人對項目經(jīng)費(fèi)管理情況的介紹，了解經(jīng)費(fèi)開支的審批權(quán)限、審批程序，及項目預(yù)算情況及實際執(zhí)行中經(jīng)費(fèi)的增減變動等情況。另外，還要了解國家對項目管理方面的法律、法規(guī)、政策及管理辦法。
4.擬定審計方案，下發(fā)審計通知書。通知書的對象為項目經(jīng)費(fèi)的直接使用管理者，即課題組(或項目負(fù)責(zé)人)，同時抄送校內(nèi)項目歸口管理部門、課題經(jīng)費(fèi)管理單位等。
（二）審計實施階段在審計實施階段，核心環(huán)節(jié)是建立相應(yīng)的內(nèi)控制度并對其執(zhí)行情況進(jìn)行測試，同時要對實質(zhì)性測試的主要步驟加以規(guī)范。需要說明的是，對于所列舉的審計程序，在實際執(zhí)行中可根據(jù)具體情況及專業(yè)判斷增加或減少相應(yīng)的審計步驟。同時，為了提高審計效率，交易業(yè)務(wù)的實質(zhì)性測試常常與控制測試同時進(jìn)行。
1.內(nèi)控制度的建立及執(zhí)行情況測試由于科研項目的審計方法尚處于探索階段，在各高校初次實施這項審計工作時，可先單獨(dú)開展科研項目的內(nèi)控制制度審計。通過對學(xué)?？蒲刑帯⒇攧?wù)處、資產(chǎn)處、“研究所”、“實驗室”、“學(xué)院”等相關(guān)職能部門項目的內(nèi)部控制制度建立及執(zhí)行情況測試，評價上述部門的項目管理職能履行情況。這是事前預(yù)防的關(guān)鍵環(huán)節(jié)，是對項目的管理職能進(jìn)行審計的重要程序，是完善監(jiān)督管理機(jī)制的關(guān)鍵。
具體如下：(1)內(nèi)部控制制度調(diào)研。對本校現(xiàn)有科研管理制度、辦法和基本情況進(jìn)行調(diào)研，據(jù)此劃分業(yè)務(wù)循環(huán)，確定關(guān)鍵控制點(diǎn)，明晰審計軌跡，進(jìn)行初步評價。(2)符合性測試。有針對性地選擇科研項目管理單位、項目所屬單位、課題組、項目負(fù)責(zé)人，通過向相關(guān)人員詢問、到現(xiàn)場觀察、穿行測試等方法，從收入管理、支出管理、實物資產(chǎn)管理、財務(wù)管理、合同管理、效益等幾個方面對科研項目內(nèi)部控制制度進(jìn)行符合性測試。(3)內(nèi)部控制制度分析評價。
2.實質(zhì)性測試學(xué)校財務(wù)管理部門一般針對每個科研項目都建立了經(jīng)費(fèi)財務(wù)卡片，分別反映每個項目的收入、支出及余額情況。按照確定的審計重點(diǎn)內(nèi)容，對其進(jìn)行實質(zhì)性測試的主要步驟如下：(1)預(yù)算執(zhí)行情況審計。經(jīng)費(fèi)管理的核心是預(yù)算及其執(zhí)行，具體又包括經(jīng)費(fèi)來源預(yù)算執(zhí)行情況審計、經(jīng)費(fèi)支出預(yù)算執(zhí)行情況審計兩個方面。前者檢查預(yù)算收入是否及時、真實、完整到位。后者主要檢查：①審計檢查決算報表數(shù)與實際支出數(shù)是否與一致，有無直接以預(yù)算核定數(shù)列支的現(xiàn)象、有無預(yù)提成本的現(xiàn)象；②檢查所有支出項目是否嚴(yán)格按照任務(wù)合同書的經(jīng)費(fèi)預(yù)算范圍、標(biāo)準(zhǔn)執(zhí)行；③檢查國家或?qū)W校有明文規(guī)定控制比例的費(fèi)用，如項目管理費(fèi)、人員費(fèi)、協(xié)作費(fèi)、業(yè)務(wù)費(fèi)，其出是否與控制比例相符；④檢查重要支出是否合法、依據(jù)是否充分；⑤分析支出是否合理，是否為課題研究必須的支出；⑥審查經(jīng)費(fèi)使用中有無擠占、挪用、損失浪費(fèi)問題，有無用于國家明文規(guī)定禁止的支出。目的在于檢查是否存在提供虛假配套承諾或不及時足額提供配套資金的問題，對預(yù)算支出的真實性、合法性進(jìn)行監(jiān)督，規(guī)范“項目負(fù)責(zé)人”的經(jīng)濟(jì)行為，及時發(fā)現(xiàn)并糾正經(jīng)費(fèi)使用中存在的問題，提高科研經(jīng)費(fèi)的使用效益。(2)課題結(jié)余經(jīng)費(fèi)審計。
具體處理三方面的問題：第一，獲取項目結(jié)題信息，了解結(jié)題時間和結(jié)余經(jīng)費(fèi)的用途。第二，檢查結(jié)題后財務(wù)結(jié)賬時間，是否進(jìn)行財務(wù)結(jié)算，是否長期掛賬報銷費(fèi)用。第三，了解結(jié)題經(jīng)費(fèi)使用規(guī)定，檢查結(jié)賬經(jīng)費(fèi)的使用是否符合規(guī)定的用途。(3)資產(chǎn)管理審計。首先獲取或編制固定資產(chǎn)明細(xì)表，進(jìn)而檢查固定資產(chǎn)的購置是否與預(yù)算相符、是否按照規(guī)定的購置程序、是否用于課題研究以及是否按照規(guī)定的用途使用，同時檢查課題研究過程中購置或試制形成的固定資產(chǎn)是否納入學(xué)校資產(chǎn)統(tǒng)一管理與核算、是否賬實相符且安全完整。另外，要注意對無形資產(chǎn)的審計。對課題研究形成的知識產(chǎn)權(quán)，要檢查其是否遵守有關(guān)管理辦法明確知識產(chǎn)權(quán)的歸屬，以及無形資產(chǎn)是否入賬等。(4)經(jīng)費(fèi)使用效益性審計。
主要依據(jù)是科研項目在任務(wù)合同書中明確了的各項技術(shù)、經(jīng)濟(jì)及社會效益指標(biāo)，如：創(chuàng)造的利潤、實現(xiàn)的產(chǎn)值、人才培養(yǎng)、論文發(fā)表數(shù)量、專利情況、獲獎情況等。具體需要獲取項目結(jié)題成果的相關(guān)指標(biāo)數(shù)據(jù)，與任務(wù)合同書約定的目標(biāo)或指標(biāo)進(jìn)行比較而做出判斷。效益中計的難點(diǎn)在于評價標(biāo)準(zhǔn)不好確定，特別是對于超出內(nèi)審人員專業(yè)知識范疇的科研領(lǐng)域問題，要充分結(jié)合領(lǐng)域?qū)＜业囊庖?，才能對效益性做出正確評價。3.審計報告編制階段完成上述審計程序后，整理工作底稿，編制審計報告。主要是對課題經(jīng)費(fèi)使用的真實性、合法性及效益性等相關(guān)問題發(fā)表審計意見。科研經(jīng)費(fèi)審計是高校內(nèi)審工作的新領(lǐng)域，目前相關(guān)的理論和實證性研究尚處于起步階段，現(xiàn)有現(xiàn)成的系統(tǒng)性經(jīng)驗可供借鑒。因此，該項工作的順利開展依賴于業(yè)內(nèi)人士長期不懈的探索和努力，在堅持理論創(chuàng)新的同時還要進(jìn)行大量的審計實踐。另一方面，高素質(zhì)的內(nèi)審專業(yè)人員隊伍，與科研領(lǐng)域?qū)＜业拈L效溝通機(jī)制，以及正確的審計觀念和良好的審計環(huán)境也是確保該項工作順利開展的必要條件，而這需要有關(guān)領(lǐng)導(dǎo)的高度重視和相關(guān)部門的大力支持才能得以真正實現(xiàn)。
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